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酶解or超声?看小美非接触超声波DNA打断仪如何大显身手

来源:上海净信  发布时间:2021-11-03 点击量:658

  在NGS检测实验中,DNA文库构建(jian)(jian)的(de)(de)第一步就是将DNA随(sui)机(ji)打(da)断(duan)(duan)成(cheng)符(fu)合各测序平台读长的(de)(de)片段。相信(xin)熟悉(xi)NGS文库构建(jian)(jian)的(de)(de)科研(yan)人员(yuan)一定(ding)纠结(jie)过这个(ge)问题,是用酶解打(da)断(duan)(duan)还是超声波打(da)断(duan)(duan)?

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  目(mu)前DNA打断(duan)的(de)最主要(yao)的(de)方法(fa)超声法(fa)和(he)酶解法(fa)。但是这(zhei)两种方法(fa)在(zai)实际使用中各(ge)具优势,需要(yao)根据实验者自身的(de)情(qing)况(kuang)进(jin)行选择(ze)。

  超声波打断法:

  操(cao)作简单,耗时短,成本低;随(sui)机片段化,无GC序(xu)列偏好;剪切效果(guo)不受(shou)DNA浓度影响(xiang)

  片(pian)(pian)段化结果集中度高(gao),目(mu)的长度片(pian)(pian)段得率(lv)高(gao)。

  酶切法:

  实验(yan)要(yao)(yao)求严格,针(zhen)对不(bu)同样本合适(shi)的(de)片(pian)段(duan)化条件(jian)摸索不(bu)易,成本较(jiao)高;存(cun)在序列(lie)偏好性(xing);需要(yao)(yao)根据样本浓度改变(bian)酶(mei)浓度,酶(mei)活性(xing)易受(shou)到溶液成分影响(xiang);目标长(zhang)度片(pian)段(duan)集中度较(jiao)低。

  超声(sheng)打断法的(de)优(you)势显而(er)易见,而(er)常用的(de)超声(sheng)波(bo)打断仪(yi)(yi)分为(wei)接(jie)触(chu)式(shi)(shi)和非(fei)接(jie)触(chu)式(shi)(shi)。相比传统的(de)探头(tou)超声(sheng)波(bo)破碎(sui)仪(yi)(yi),探头(tou)与样(yang)(yang)品(pin)直接(jie)接(jie)触(chu),一次(ci)只能处理一个样(yang)(yang)品(pin),实(shi)验周(zhou)期长。小美非(fei)接(jie)触(chu)超声(sheng)波(bo)DNA打断仪(yi)(yi)Plus系列产品(pin)可在密闭容器(qi)下(xia)进行破碎(sui),不(bu)(bu)产生感染(ran)性飞雾(wu),超声(sheng)探头(tou)与样(yang)(yang)品(pin)不(bu)(bu)接(jie)触(chu),避免(mian)交(jiao)叉污染(ran)。对于(yu)每天要处理多个样(yang)(yang)品(pin)或者贵重样(yang)(yang)品(pin)的(de)实(shi)验室,此款仪(yi)(yi)器(qi)具有处理高通量,样(yang)(yang)本(ben)低损耗,无交(jiao)叉污染(ran)等优(you)势。逐渐成为(wei)ChIP(染(ran)色(se)质免(mian)疫共沉淀)和DNA剪切研究(jiu)平台不(bu)(bu)可缺少的(de)标准化工具。

  小美超(chao)(chao)声(sheng)非接触超(chao)(chao)声(sheng)波DNA打断仪Plus系列产(chan)品具有通量高、实(shi)验(yan)一致性好(hao),实(shi)验(yan)重复性好(hao)、片(pian)段(duan)得率高等优点。专为二代测(ce)序DNA样本与染色(se)质(zhi)免(mian)疫共沉淀(dian)实(shi)验(yan)样本前处理(li)量身订做的,应(ying)用(yong)领域包含:细菌(jun)细胞破碎、蛋白质(zhi)抽提(ti);二代测(ce)序样本DNA片(pian)段(duan)化;霉菌(jun)孢子破碎、乳化、均质(zhi)、加速溶解、催化反(fan)应(ying)等。

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  采(cai)用等温、非接触的方(fang)式对样品进行打断、匀(yun)浆和混合;用于(yu)无菌、可超微量破碎(sui),隔(ge)着(zhe)离心(xin)管能打断染色体。深受各大(da)基(ji)因公(gong)司、生物(wu)公(gong)司、测序(xu)公(gong)司的青睐!


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