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中国人自己的单细胞测序仪来了

来源:本站  发布时间:2017-09-30 点击量:879

过去两年有一项大热的技术,大量研究人员通过这项技术解决重要科学问题,发表了大量高水平学术文章,这项技术便是单细胞测序技术。

单细胞测序技术,在这两(liang)年(nian)得到了蓬勃发展。一些高通量的单细胞测序平台开始为大家所熟知。有10×genomics单细胞测序平台、以及(ji)Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。

这些平(ping)台在很(hen)(hen)大(da)程度(du)上降低(di)了(le)单(dan)(dan)细(xi)胞(bao)(bao)(bao)测(ce)(ce)序(xu)的(de)(de)成(cheng)本(ben),使得(de)单(dan)(dan)个(ge)(ge)细(xi)胞(bao)(bao)(bao)的(de)(de)测(ce)(ce)序(xu)成(cheng)本(ben)变得(de)极低(di)。虽然(ran)单(dan)(dan)个(ge)(ge)细(xi)胞(bao)(bao)(bao)的(de)(de)成(cheng)本(ben)降低(di)了(le),但一个(ge)(ge)样本(ben)需(xu)要产(chan)生大(da)量细(xi)胞(bao)(bao)(bao)的(de)(de)数据,所以单(dan)(dan)个(ge)(ge)样本(ben)的(de)(de)成(cheng)本(ben)并没有(you)很(hen)(hen)低(di)。大(da)多(duo)数的(de)(de)研究者会(hui)因这几(ji)十(shi)万甚(shen)至(zhi)上百(bai)万的(de)(de)测(ce)(ce)序(xu)成(cheng)本(ben)而对单(dan)(dan)细(xi)胞(bao)(bao)(bao)测(ce)(ce)序(xu)研究望(wang)而却步。有(you)些希望(wang)从事单(dan)(dan)细(xi)胞(bao)(bao)(bao)研究或者希望(wang)提供单(dan)(dan)细(xi)胞(bao)(bao)(bao)测(ce)(ce)序(xu)服务的(de)(de)单(dan)(dan)位,也会(hui)因为测(ce)(ce)序(xu)平(ping)台高昂的(de)(de)价格而犹(you)豫不(bu)决。

在这种形式下,上海净信潜心研(yan)发(fa)两(liang)年多,重磅推出了国(guo)内(nei)第一(yi)(yi)家,全球第五家的单细(xi)胞(bao)测序平(ping)台(tai)(tai)。填补了国(guo)内(nei)在(zai)单细(xi)胞(bao)测序平(ping)台(tai)(tai)制造上(shang)的空(kong)白(bai)。该平(ping)台(tai)(tai)基于(yu)Drop-seq的技术原(yuan)理(li),能(neng)够一(yi)(yi)次完成数千甚(shen)至(zhi)上(shang)万细(xi)胞(bao)的单细(xi)胞(bao)测序。

大家所熟知的10×genomics单细胞胞测序平台依托的技术手段称之为inDrop-seq,论文在2015年发表与Cell杂志。该方法利用微液滴技术将带有条形码、索引分子、引物及其他的凝胶珠与单细胞混合。每个液滴内开展逆转录反应,以产生测序所用的带有条形码的cDNA。

10×genomics单细胞测序平台原理图
有意思的是,净信使用的Drop-seq技术与inDrop-seq技术发表与同一期的Cell杂志上。Drop-seq也是利用微流控技术将细胞分开,并与带有特定条形码的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)将细胞内的信使RNA捕获。收集磁珠净信逆转录和扩增,得到测序所用的带有条形码的cDNA。与inDrop-seq不同的是,Drop-seq的逆转录的过程是在液滴外进行的,这样逆转录的效率会更高。

净信单细胞测序仪原理图
净信的单细胞测序仪不管是从原理还是从测试结果看,都完全能媲美进口仪器。它每个样本能够产生5000~10000个细胞,对上机样本的要求不再那么严苛。为防止实验失败造成的损失,机器还特别添加了能够监控实验过程的系统,一旦出现管道堵塞等情况,便可以及时止损。而最最最关键的还是:该平台不论是从机器的购买成本,还是试剂耗材的成本都非常低。该平台的问世,再次将单细胞测序的价格拉低了一个台阶,使得更多的研究人员能够去利用这一先进的技术手段进行研究工作。

净信单细胞测序仪样机图
净(jing)信诚(cheng)邀各(ge)大(da)测(ce)序(xu)公(gong)司、精准医(yi)疗及技(ji)术服务公(gong)司一起合作(zuo),为单细胞测(ce)序(xu)的发展贡献力量。有合作(zuo)意向(xiang)请拨打:021-57790908,邮箱:13761884588@163.com


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